دلیل لکنت زبان بسته به نوع آن متفاوت است. معمولا لکنت زبان از سنین 2 تا 6 سالگی شروع می شود. در 70 درصد کودکان، لکنت زبان بعد از یک فشار روانی آغاز می شود و در 24 درصد کودکان لکنت زبان بعد از تماس با فردی لکنت دار تقلید و آغاز می شود و در 6 درصد کودکان والدین نیز علتی برای آغاز لکنت زبان در فرزند خود بیان نمی کنند. 85 درصد افراد لکنتی پیش از 8 سالگی شروع به لکنت کردن می کنند که معمولا یا بین 2 تا 3 سالگی وقتی که کودک شروع به صحبت کردن می کند اتفاق می افتد و یا بین 6 تا 8 سالگی وقتی که بلافاصله پس از شروع مدرسه رفتن، خواندن یاد می گیرد. تعداد کمی پس از 10 سالگی شروع به لنت کردن می کنند. لکنت زبان می تواند اختلالی در بخش تولید و پردازش گفتار در سیستم عصبی (لوب گیجگاهی) باشد و یا می تواند به علت گرفتگی یا اسپاسم تارهای صوتی به دنبال فشار روانی و افزایش تنش عضلانی باشد. لکنت امکان دارد به صورت ژنتیکی به افراد به ارث برسد و یا به صورت محیطی و اکتسابی فرد دچار آن شود. همانطور که گفته شد لکنت زبان معمولا به دنبال فشارهای روانی ایجاد می شود و یا کودک از کودکی دیگر که لکنت دارد تقلید می کند و او هم دچار لکنت می شود. لکنت زبان می تواند به دنبال ابتلا به بیماری و آسیب به سیستم عصبی (نورولوژیک) به وجود آید و یا به دنبال آسیب های سایکولوژیک و روانشناختی مانند ترس، استرس و اضطراب به وجود آید مانند لکنت ناگهانی در کودکان و بزرگسالان. 

دلیل لکنت زبان در کودکان شامل موارد زیر است:

-فشار روانی بیش از آستانه ی تحمل کودک 

-تماس کودک با افراد لکنت دار در مهدکودک، همسایه ها و مهمانی ها و تقلید کردن از آنها

-تنبیه بدنی شدید توسط والدین یا اقوام نزدیک

-ترساندن کودک توسط پدر،مادر یا اقوام

-ترسیدن کودک از حیوانات 

-برانگیختن حس حسادت کودک با تولد یک نوزاد در خانواده یا مقایسه کردن او با کودکان دیگر

-شرم والدین از بیان اتفاق (مانند مشاهده ی روابط والدین و …)

-ترس هایی که در تاریکی به وجود می آید (هنگامی که شب ها از خواب می پرد)

-مشاهده بازی ها و کارتون های ترسناک